на основании каждой из накладных, которую корректируют, по кнопке Ввести на основании, выбираете Корректировка поступления, она заполниться по накладной. Вам придется сделать корректировку на каждую накладную, т.к. нет возможности заполнять их и по другим накладным.
А т.к. счет фактуру Вам выставляют одну, то вводите ее только на основании (по гипер ссылке в документе Исправления) последней исправленной накладной, в счет-фактуре нажимаете кнопку СПИСОК и в изменившейся форме дополняете всеми остальными документами Корректировка поступления