Здравствуйте!
Товарный отчет (ТОРГ-29) можно сформировать только по складу с видом "Розничный" или "Неавтоматизированная торговая точка" и для организации, которая ведет учет товаров в рознице по продажным ценам. Способ оценки товаров в рознице задается в учетной политике организации.
Хм, подсказать то наверное и нечего. В типовой БП Торг-29 для опта не предусмотрена. Или ждать когда 1С все таки решить разработать такой отчет или заказывать у кого-нибудь. Можете и тут заказать - создайте тему в разделе "Заказы на разработку".